專利侵權糾紛中的被控侵權方當事人在收到警告函或者法院應訴通知書后，應當冷靜、及時應對。總體決策思路如下：
（1）決策摸底準備。
首先，由專業人士對以下事實進行評估：被控侵權產品與生成被侵權的專利進行對比分析，評估是否侵權；涉案專利的有效性；侵權訴訟勝訴的可能性；直接訴訟成本，如法律服務費用；間接訴訟成本，如企業可能進行的訴訟可能損失的訂單、市場等。
其次，可以視情況與權利人接觸，了解對方的意圖、底線。
最后，評估、統計己方的資源，例如能夠給對方造成壓力的手段（如專利、市場行為）、己方商譽的承受力、能夠聯合的盟友等。
（2）決策考慮因素。
專利訴訟決策首要考慮因素不是勝敗的幾率，而是可能產生的訴訟成本和收益。如果贏得專利訴訟將付出高昂的代價，或者可能贏得的市場極度不對稱，則無論訴訟成敗都將是得不償失的。
若經過評估，當前企業存在的特殊情況：如特定時期不能影響重要客戶的信心或者企業正在從事其他重要法律活動，必須避免侵權訴訟的發生，則應有理有節地回應權利人，同時展開談判，盡量在能夠承受的成本范圍內達成和解。
若經過評估，專利侵權訴訟不侵權抗辯勝訴幾率較高，但可能付出較大代價，例如可能因侵權風險而損失大量訂單和造成損失，或者引發專利戰，或者法律服務成本費用遠遠高于和解代價，則同樣不宜貿然選擇進行訴訟，而應積極探尋解決問題的非訴途徑。
若經過評估，認為確實極有可能被認定為專利侵權，且涉案專利權相對穩定，專利侵權訴訟則一般情況下應立即停止侵權行為，撤出相關市場。但是，如果由此造成的損失極大甚至對企業的生存造成實質影響，則被控侵權企業一方面應當做好盡可能充分的應訴準備，另一方面以最大努力及誠意促進和談，爭取代價最低的和解條件達成。
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